Les symptômes du lipome dépendent évidement de sa localisation: dans le cas le plus fréquent, celui du lipome sous-cutané, une bosse visible apparaît progressivement sous la peau. Les lipomes internes peuvent passer inaperçus et n'être découverts qu'à l'occasion d'examens de routine.
On les retrouve fréquemment dans le dos ou au niveau du cou. Ils se présentent sous la forme d'une boule pâteuse, molle, qui peut se déplacer, glisser sous la peau. Certains lipomes sous-cutanés peuvent être à l'origine de douleurs chroniques lorsqu'ils sont innervés ou lorsqu'ils compriment ou étirent des racines nerveuses ( voir : lipome douloureux).